Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR2AP24928 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLR2AP24928 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms