Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XPAP23025 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XPAP23025 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XPAP23025 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XPAP23025 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XPAP23025 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XPAP23025 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XPAP23025 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XPAP23025 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XPAP23025 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XPAP23025 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XPAP23025 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms