Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms