Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIG1P18858 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIG1P18858 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIG1P18858 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIG1P18858 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIG1P18858 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIG1P18858 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIG1P18858 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIG1P18858 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LIG1P18858 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIG1P18858 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIG1P18858 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIG1P18858 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIG1P18858 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIG1P18858 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIG1P18858 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIG1P18858 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIG1P18858 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIG1P18858 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIG1P18858 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIG1P18858 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIG1P18858 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIG1P18858 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIG1P18858 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIG1P18858 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIG1P18858 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIG1P18858 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIG1P18858 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIG1P18858 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIG1P18858 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIG1P18858 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIG1P18858 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIG1P18858 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LIG1P18858 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIG1P18858 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIG1P18858 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIG1P18858 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIG1P18858 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIG1P18858 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIG1P18858 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIG1P18858 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIG1P18858 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIG1P18858 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIG1P18858 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIG1P18858 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIG1P18858 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIG1P18858 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIG1P18858 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIG1P18858 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIG1P18858 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms