Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms