Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSP16219 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSP16219 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSP16219 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSP16219 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSP16219 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSP16219 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSP16219 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSP16219 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSP16219 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSP16219 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSP16219 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSP16219 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSP16219 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSP16219 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSP16219 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSP16219 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSP16219 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSP16219 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSP16219 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSP16219 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSP16219 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSP16219 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSP16219 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSP16219 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSP16219 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSP16219 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSP16219 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSP16219 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACADSP16219 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSP16219 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSP16219 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSP16219 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSP16219 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSP16219 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSP16219 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSP16219 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSP16219 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSP16219 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSP16219 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSP16219 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSP16219 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSP16219 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSP16219 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSP16219 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSP16219 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSP16219 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSP16219 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSP16219 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSP16219 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSP16219 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSP16219 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSP16219 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSP16219 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSP16219 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSP16219 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSP16219 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACADSP16219 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
ACADSP16219 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ACADSP16219 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ACADSP16219 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ACADSP16219 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACADSP16219 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSP16219 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSP16219 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSP16219 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSP16219 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSP16219 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSP16219 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSP16219 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACADSP16219 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms