Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAV1P15498 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAV1P15498 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAV1P15498 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAV1P15498 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VAV1P15498 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAV1P15498 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAV1P15498 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAV1P15498 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAV1P15498 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAV1P15498 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAV1P15498 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VAV1P15498 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAV1P15498 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAV1P15498 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAV1P15498 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAV1P15498 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAV1P15498 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAV1P15498 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAV1P15498 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAV1P15498 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAV1P15498 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAV1P15498 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAV1P15498 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VAV1P15498 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAV1P15498 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAV1P15498 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAV1P15498 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAV1P15498 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAV1P15498 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAV1P15498 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAV1P15498 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAV1P15498 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAV1P15498 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAV1P15498 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms