Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms