Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMC1P11047 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMC1P11047 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms