Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GLI4P10075 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI4P10075 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI4P10075 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI4P10075 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI4P10075 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI4P10075 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI4P10075 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI4P10075 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI4P10075 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI4P10075 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI4P10075 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI4P10075 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI4P10075 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI4P10075 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI4P10075 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI4P10075 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI4P10075 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI4P10075 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI4P10075 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI4P10075 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI4P10075 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI4P10075 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI4P10075 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI4P10075 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI4P10075 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GLI4P10075 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GLI4P10075 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GLI4P10075 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GLI4P10075 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GLI4P10075 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GLI4P10075 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GLI4P10075 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GLI4P10075 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GLI4P10075 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GLI4P10075 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GLI4P10075 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GLI4P10075 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GLI4P10075 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GLI4P10075 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GLI4P10075 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GLI4P10075 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms