Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CT47B1P0C2W7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms