Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOA1P02647 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOA1P02647 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOA1P02647 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOA1P02647 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOA1P02647 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APOA1P02647 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APOA1P02647 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOA1P02647 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOA1P02647 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOA1P02647 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOA1P02647 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOA1P02647 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOA1P02647 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOA1P02647 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOA1P02647 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOA1P02647 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOA1P02647 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOA1P02647 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOA1P02647 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOA1P02647 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOA1P02647 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOA1P02647 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms