Protein–RNA interactions for Protein: O94913

PCF11, Pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCF11O94913 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCF11O94913 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PCF11O94913 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCF11O94913 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCF11O94913 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCF11O94913 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCF11O94913 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCF11O94913 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCF11O94913 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCF11O94913 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCF11O94913 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCF11O94913 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCF11O94913 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCF11O94913 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCF11O94913 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCF11O94913 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCF11O94913 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCF11O94913 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCF11O94913 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCF11O94913 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCF11O94913 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCF11O94913 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCF11O94913 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCF11O94913 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCF11O94913 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCF11O94913 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCF11O94913 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PCF11O94913 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCF11O94913 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PCF11O94913 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCF11O94913 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCF11O94913 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PCF11O94913 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCF11O94913 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCF11O94913 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCF11O94913 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCF11O94913 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCF11O94913 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCF11O94913 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCF11O94913 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCF11O94913 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCF11O94913 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCF11O94913 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCF11O94913 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCF11O94913 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCF11O94913 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCF11O94913 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCF11O94913 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCF11O94913 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCF11O94913 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCF11O94913 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCF11O94913 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCF11O94913 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCF11O94913 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCF11O94913 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PCF11O94913 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PCF11O94913 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PCF11O94913 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCF11O94913 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCF11O94913 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCF11O94913 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCF11O94913 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCF11O94913 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCF11O94913 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCF11O94913 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCF11O94913 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCF11O94913 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCF11O94913 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCF11O94913 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCF11O94913 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCF11O94913 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCF11O94913 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCF11O94913 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCF11O94913 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCF11O94913 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCF11O94913 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCF11O94913 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCF11O94913 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCF11O94913 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCF11O94913 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCF11O94913 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCF11O94913 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCF11O94913 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCF11O94913 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PCF11O94913 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCF11O94913 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCF11O94913 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCF11O94913 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PCF11O94913 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCF11O94913 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCF11O94913 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCF11O94913 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCF11O94913 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCF11O94913 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCF11O94913 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCF11O94913 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCF11O94913 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCF11O94913 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCF11O94913 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCF11O94913 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms