Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNKO75909 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNKO75909 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNKO75909 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNKO75909 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNKO75909 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNKO75909 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNKO75909 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNKO75909 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNKO75909 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNKO75909 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNKO75909 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNKO75909 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNKO75909 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNKO75909 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNKO75909 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNKO75909 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNKO75909 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNKO75909 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNKO75909 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNKO75909 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCNKO75909 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNKO75909 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNKO75909 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNKO75909 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms