Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP4O75379 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms