Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PITX3O75364 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PITX3O75364 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PITX3O75364 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PITX3O75364 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PITX3O75364 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PITX3O75364 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PITX3O75364 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PITX3O75364 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PITX3O75364 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PITX3O75364 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PITX3O75364 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PITX3O75364 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PITX3O75364 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PITX3O75364 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PITX3O75364 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms