Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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