Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A4O43246 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A4O43246 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A4O43246 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A4O43246 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A4O43246 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A4O43246 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A4O43246 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A4O43246 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A4O43246 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A4O43246 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A4O43246 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A4O43246 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A4O43246 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A4O43246 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A4O43246 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A4O43246 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A4O43246 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A4O43246 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A4O43246 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A4O43246 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A4O43246 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A4O43246 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC7A4O43246 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms