Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VGFO15240 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VGFO15240 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VGFO15240 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VGFO15240 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VGFO15240 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VGFO15240 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VGFO15240 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VGFO15240 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VGFO15240 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VGFO15240 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VGFO15240 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VGFO15240 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VGFO15240 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VGFO15240 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VGFO15240 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VGFO15240 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VGFO15240 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VGFO15240 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VGFO15240 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VGFO15240 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VGFO15240 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VGFO15240 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VGFO15240 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VGFO15240 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VGFO15240 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VGFO15240 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VGFO15240 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VGFO15240 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VGFO15240 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VGFO15240 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VGFO15240 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VGFO15240 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VGFO15240 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VGFO15240 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VGFO15240 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VGFO15240 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VGFO15240 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VGFO15240 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VGFO15240 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VGFO15240 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VGFO15240 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VGFO15240 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VGFO15240 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VGFO15240 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VGFO15240 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VGFO15240 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VGFO15240 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VGFO15240 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VGFO15240 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VGFO15240 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VGFO15240 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VGFO15240 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VGFO15240 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VGFO15240 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VGFO15240 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VGFO15240 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VGFO15240 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VGFO15240 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VGFO15240 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VGFO15240 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VGFO15240 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VGFO15240 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VGFO15240 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VGFO15240 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VGFO15240 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VGFO15240 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VGFO15240 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VGFO15240 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VGFO15240 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VGFO15240 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VGFO15240 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VGFO15240 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VGFO15240 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VGFO15240 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VGFO15240 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VGFO15240 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VGFO15240 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VGFO15240 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VGFO15240 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VGFO15240 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VGFO15240 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VGFO15240 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VGFO15240 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VGFO15240 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VGFO15240 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VGFO15240 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VGFO15240 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VGFO15240 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VGFO15240 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VGFO15240 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VGFO15240 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VGFO15240 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VGFO15240 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VGFO15240 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VGFO15240 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VGFO15240 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VGFO15240 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VGFO15240 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VGFO15240 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
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