Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLGNO14967 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLGNO14967 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLGNO14967 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLGNO14967 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLGNO14967 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLGNO14967 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLGNO14967 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLGNO14967 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLGNO14967 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLGNO14967 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLGNO14967 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLGNO14967 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms