Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKBIEO00221 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKBIEO00221 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIEO00221 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIEO00221 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIEO00221 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIEO00221 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIEO00221 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIEO00221 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIEO00221 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIEO00221 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIEO00221 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIEO00221 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIEO00221 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIEO00221 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIEO00221 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIEO00221 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIEO00221 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIEO00221 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIEO00221 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIEO00221 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIEO00221 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIEO00221 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIEO00221 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFKBIEO00221 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFKBIEO00221 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFKBIEO00221 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFKBIEO00221 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFKBIEO00221 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKBIEO00221 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms