Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEDD8-MDP1E9PL57 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms