Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms