Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00587B1AMM8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00587B1AMM8 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms