Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD1B0YJ81 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms