Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SDR42E2A6NKP2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDR42E2A6NKP2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms