Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPIPB13A6NJU9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPB13A6NJU9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms