Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC78A2IDD5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms