Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PIPSLA2A3N6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms