Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH30

IGHV3-16, Immunoglobulin heavy variable 3-16 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-16A0A0C4DH30 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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IGHV3-16A0A0C4DH30 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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IGHV3-16A0A0C4DH30 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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IGHV3-16A0A0C4DH30 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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IGHV3-16A0A0C4DH30 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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IGHV3-16A0A0C4DH30 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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IGHV3-16A0A0C4DH30 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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IGHV3-16A0A0C4DH30 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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IGHV3-16A0A0C4DH30 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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IGHV3-16A0A0C4DH30 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IGHV3-16A0A0C4DH30 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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IGHV3-16A0A0C4DH30 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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IGHV3-16A0A0C4DH30 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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