Protein–RNA interactions for Protein: V9GYS6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYS6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V9GYS6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
V9GYS6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
V9GYS6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
V9GYS6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
V9GYS6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V9GYS6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V9GYS6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V9GYS6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
V9GYS6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYS6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYS6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYS6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYS6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYS6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYS6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYS6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYS6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYS6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYS6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYS6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYS6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYS6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYS6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYS6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms