Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPRBQ9Y5M8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms