Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC8Q9Y2L5 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms