Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX4Q9Y2E6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms