Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLEC4AQ9UMR7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms