Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBE1Q9UJT0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms