Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID3

VPS51, Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS51Q9UID3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS51Q9UID3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms