Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CGGBP1Q9UFW8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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