Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM8A1Q9UBU6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms