Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP35Q9P2H5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
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