Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms