Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCMF1Q9P0J7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms