Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDE1Q9NZC3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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