Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIN1Q9NXP7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms