Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms