Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT82Q9NSB4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms