Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NRIP3Q9NQ35 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms