Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMURF2Q9HAU4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMURF2Q9HAU4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMURF2Q9HAU4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMURF2Q9HAU4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMURF2Q9HAU4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMURF2Q9HAU4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMURF2Q9HAU4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMURF2Q9HAU4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMURF2Q9HAU4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMURF2Q9HAU4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMURF2Q9HAU4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMURF2Q9HAU4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMURF2Q9HAU4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMURF2Q9HAU4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMURF2Q9HAU4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMURF2Q9HAU4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms