Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL4Q9C0H6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms