Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LNPKQ9C0E8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNPKQ9C0E8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms